简介

　　基因表达谱测序为对组织或细胞在特定状态下产生的 mRNA进行高通量测序分析，得到基因差异表达的情况。测序法进行基因表达分析具有定量准确，重复性、特异性、灵敏性高的特点。与全转录组测序研究相比，表达谱测序采用单端或双端读长的策略，测序通量较小，成本较低；与芯片法相比，测序法具有无需样本序列信息即可实现任一物种已知和未知转录本差异研究的开放性特点，对低丰度转录本的检测具有灵敏性和特异性高的优点。客户可根据实验目的，灵活选择合适的测序深度，以达到对不同丰度转录本的检测要求。一般 10M~20M reads数的测序量即可检测到比芯片更多的差异基因。如果对低丰度表达基因的关注度高，建议至少测 30M以上的 reads。

技术路线

结果列表

1、测序数据评估与统计；

2、基因表达水平分析；

3、样品间差异比较分析；

4、GO/KEGG富集分析；

5、基因共表达网络构建；

6、蛋白互作网络分析

结果展示

1、GO功能分析

2、Pathway 富集分析（红色标记为差异基因）

3、差异基因共表达网络图

差异基因蛋白网络互作网络图

4、差异基因蛋白网络互作网络图

样品要求

1、总RNA：浓度≥200 ng/μl，总量≥10 μg；

2、组织样品：动物、植物、微生物总量大于300 mg的新鲜样品。

3、血液2ml以上，血清1ml以上。

4、保存在超低温冰箱中，利用干冰运输。

参考文献

1、Huan Chen, Fa-Wei Wang, Yuan-Yuan Dong, et al. Sequence mining and transcript profiling to explore differentially expressed genes associated with lipid biosynthesis during soybean seed development. BMC Plant Biology, 2012, 12: 122-136.

2、Vagmita Pabuwal, Mikki Boswell, Amanda Pasquali, et al. Transcriptomic analysis of cultured whale skin cells exposed to hexavalent chromium [Cr(VI)]. Aquatic Toxicology, 2013, 134-135: 74-81.