简介

  MeDIP-Seq是基于免疫富集原理进行的全基因组DNA甲基化研究方法，通过5"-甲基胞嘧啶（5mC）抗体将基因组中的DNA甲基化区域富集后进行高通量测序，从而检测基因组上高CpG区域的甲基化位点。通过MeDIP-Seq技术可以快速准确地寻找样品间相对DNA甲基化差异区域，进行不同细胞、组织样本间的DNA甲基化修饰模式的差异分析,该方法可以高效、经济地比较大样本量细胞、组织等样品间的相对甲基化差异，且成本较低，适合大样本量表观遗传学的研究。言行生物还提供WGBS/RRBS甲基化测序服务，质量高。

一、技术路线

二、生物信息分析

1、原始数据产出统计。    

2、MeDIP-Seq序列与参考序列比对。    

3、统计 reads在全基因组的分布情况。    

4、统计 reads在CpG区域的分布情况。    

5、统计 reads在不同功能元件区域（Promoter，UTR，Exon，Intron）的分布情况。    

6、统计 reads在不同 GC含量区域中的分布情况。    

7、统计序列富集区域（peak）。    

8、统计与 peak相关的基因。    

9、统计 peak在不同功能元件区域（Promoter，UTR，Exon，Intron）的分布情况。  

10、多样本 peak差异分析及差异 peak相关基因注释、 GO分类和 pathway显著性富集分析。  

11、与表达谱进行关联分析，预测甲基化调控基因（需有表达谱数据）。  

12、MeDIP-Seq数据可视化分析：生成 Genome Browser可以导入的文件。

三、结果展示

1、reads在CpG、Promoter和基因组的分布

2、peak在不同功能元件区域的分布

3、差异peak列表

4、差异peak比较图

四、样品要求

1、样品类型：血液、细胞、新鲜组织或DNA样品。    

2、样品量：细胞样品请提供至少2×10⁷个细胞，组织样品请提供至少100mg的组织块或切片，DNA样品请提供10 μg以上。