简介

　　非靶向代谢组学（即发现代谢组学）主要是将对照组和实验组的代谢组（某一生物体的全部代谢物）进行比对，以找出其代谢物的差异。其分析一般包括：

    1、代谢谱分析（也称为差异表达分析）：在一组实验和对照样品中，寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物。

    2、鉴定：进行代谢谱分析后，鉴定这些代谢物的名称或化学结构。

    3、解释：研究流程的最后一步，解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联。

实验流程









数据分析






非靶向代谢组学常用LC/MS、GC/MS、NMR三种检测手段，优缺点如下表。

检测手段	优 点	缺 点
LC/MS	灵敏度较高，无需衍生化，适合极性较大物质	分离率不高，时间较长，具有偏向性
GC/MS	较好的分离效率和检测灵敏度、适合极性较小物质	衍生化限制了应用范围，具有偏向性
NMR	精度高、对样品限制少、不破坏样品	灵敏度较低、动态范围有限




技术优势

1、拥有标准化的实验室操作规范和先进的仪器平台，实验周期短，质量可靠。

2、拥有Waters XEVO GS-2 Q-TOF（UPLC)液质联用仪、Agilent 7890A-5975C气质联用仪和AVANCE III 600 MHz NMR等多种非靶向仪器平台。

3、多个商业数据库、引入保留指数、超过百个的标准品库，使GC-MS定性能力更强。

4、拥有专业的生物信息团队和大型硬件，可以为客户提供个性化的生物信息分析服务。

结果展示

1、各样品检测出的代谢物的聚类分析图



2、样品主成分分析（PCA）









3、PLSDA分析图






4、实验组和对照组的差异代谢物列表






5、差异代谢物biomarker的ROC曲线分析



6、差异代谢物的常规代谢通路分析（红色点表示检测到的差异代谢物）



7、绘制代谢网络图（红色为上调的代谢物，蓝色为下调的代谢物）



样品要求

1、植物样本最少200mg,血液样品至少1ml(血浆注意用肝素钠防凝),血清0.5ml,尿液2ml，动物组织样品至少1g，细胞样品为1×10⁷个细胞，酵母、微生物等干重200mg。

2、样品保存与运输：在液氮或-80°C保存。干冰运输。

3、生物学重复次数：一般来说，植物、细胞、微生物等至少6个生物学重复，动物样本，由于其个体化差异较大，包括组织、血、尿液等至少10个生物学重复。临床样本，个体差异更大，血浆、尿液等至少要在30个生物学重复左右，无上限。具体根据文章发表档次和实验设计而定。

参考文献

[1]    Hahm ER, Lee J, et al. Metabolic alterations in mammary cancer prevention by withaferin A in a clinically relevant mouse model. J Natl Cancer Inst. 2013; 105(15): 1111-22.

[2]    Nørskov NP, Hedemann MS, et al. Multicompartmental nontargeted LC-MS metabolomics: explorative study on the metabolic responses of rye fiber versus refined wheat fiber intake in plasma and urine of hypercholesterolemic pigs. JProteome Res. 2013; 12(6): 2818-32.

[3]    Huang Q, Tan Y, et al. Metabolic characterization of hepatocellular carcinoma using nontargeted tissue metabolomics. Cancer Res. 2013; 73(16): 4992-5002.